Οι Έλληνες Γιατροί του Κόσμου είναι μία Μη Κυβερνητική Οργάνωση, ανεξάρτητη, οικονομικά αυτόνομη, στηριζόμενη αποκλειστικά στην εθελοντική προσφορά.

Πηγές χρηματοδότησης αποτελούν:

• Συνδρομές και δωρεές μελών και φίλων τις οργάνωσης: το θεμέλιο της Οργάνωσης. Μέλη και φίλοι της οργάνωσης, απλοί άνθρωποι που στηρίζουν το έργο μας καθημερινά.
• Χορηγίες Εταιρειών και Ιδρυμάτων: αναζητούμε χορηγούς μεταξύ εταιρειών και ιδρυμάτων, που θα μας βοηθήσουν στα νέα σημαντικά προγράμματα μας στην Ελλάδα.
• Ταμεία της Ευρωπαϊκής 'Ένωσης, Κρατικών και Διεθνών Οργανισμών: από εκεί κυρίως προέρχονται οι πόροι μας για τις αποστολές στο εξωτερικό.
• Κληροδοτήματα: αποτελούν στόχο και αναγκαιότητα. Η εξασφάλιση τους θα βοηθήσει ώστε να καλύπτονται τα ετήσια λειτουργικά έξοδα.

Η κύρια πηγή πόρων, ο ακρογωνιαίος λίθος της δραστηριότητας μας είναι ο ανώνυμος πολίτης που σε κάθε έκκλησή μας συμβάλλει, ακόμα και από το υστέρημά του, για την υλοποίηση των αποστολών μας. Είναι άνθρωποι σαν και εσάς, σαν και εμάς, σαν όλους μας, που στις τόσες πολλές καθημερινές τους έννοιες, προσθέτουν και άλλη μία. Να βοηθούν τον συνάνθρωπο.

Βασική προτεραιότητα δίνεται στη μείωση των εξόδων λειτουργίας των γραφείων, των δαπανών παράστασης και των δαπανών δημοσίων σχέσεων και προβολής, ούτως ώστε όλα τα έσοδα να διατίθενται πραγματικά για τη χρηματοδότηση των αποστολών.

Οι Γιατροί του Κόσμου πιστεύουν στην ανάγκη προβολής του έργου τους και ευαισθητοποίησης της κοινής γνώμης για τα μεγάλα ζητήματα της ανθρωπιστικής δράσης. Ταυτόχρονα όμως είναι αντίθετοι στην εκμετάλλευση των ανθρωπίνων διαθέσεων του απλού πολίτη, ή στη βιομηχανία του ανθρωπιστικού marketing, για λόγους προβολής και διαφήμισης.